Nach dem Ausführen von "START" stehen Knotenboxen Merkmalen der einzelnen Knoten im Baum, die gerenderte Grafik (SVG) sowie eine Box mit dem DOT-Code, der den Graphen repräsentiert bzw. erstellt. Alle drei Bereiche können zum Editieren genutzt werden und haben teilweise überlappende, teilweise aber auch individuelle Möglichkeiten.
Funktionen für einen oder mehrere markierte Knoten (shift-click; nur zuletzt markierter Knoten wird angezeigt):
